Partenariat avec l’industrie pharmaceutique
31/12/2009
Le Centre de Lutte Contre le Cancer Nantes-Atlantique offre à ses partenaires industriels un arsenal de moyens technologiques et de compétences regroupé sous la forme d'une plate-forme de Recherche clinique incluant notamment une unité de phase 1, et des laboratoires de transfert permettant une expertise complète des tumeurs d'intêret (Génomique - Protéomique - Tumorothèque - Biopathologie / puce -µarray - Imagerie moderne)
Le Centre d'évaluation clinique (CEC)
Troisième plus gros Centre de Lutte Contre le Cancer en terme d'inclusion sur le plan national :
- 640 patients inclus soit 16% des patients traités au Centre 
- 27% des chimio-thérapie dispensées au centre, le sont dans le cadre d'essais thérapeutiques.
Il est animé par un coordinateur qui organise le travail de 12 ARC(s)
Le CEC partage avec le Centre Hospitalier Universitaire de Nantes une cellule de promotion.
Il participe à 250 essais annuels en moyenne.
L'unité de développement thérapeutique précoce,
d'une capacité de 8 places, travaille en étroite collaboration avec un laboratoire de pharmacocinétique qui traite chaque année plus de 4000 prélèvements, en s'appuyant sur un personnel spécifiquement dédié.
Le laboratoire de pharmacocinétique
Le laboratoire de pharmacocinétique participe au sein du Centre d'Evaluation Clinique à la mise en place et au suivi des études pharmacocinétiques au cours du développement des nouvelles molécules. Différents médicaments font l'objet d'un suivi individualisé :
- le 5 fluorouracile et l'enzyme clé de sa dégradation (DPD),
- le méthotrexate,
- le platine,
- le topotecan.
Un grand nombre de travaux menés par le laboratoire du Centre sont réalisés dans le cadre du Groupe de Pharmacologie Clinique Oncologique (GPCO) de la Fédération Nationale des Centres de Lutte Contre le Cancer.
La tumorothèque
Depuis 1998, une biothèque " cancer du sein ", alimentée par l'activité chirurgicale du centre, a été mise en place afin de conserver des fragments de tumeurs d'intérêt, 
riches d'informations à extraire. Cette activité de Cryoconservation a fortement augmenté en 2001, puisqu'à partir de cette date, le CRG et le CHU de Nantes ont mutualisé leurs collections biologiques, dans le cadre d'une structure commune labellisée et soutenue par le Ministère de la Santé. En 2005 c'est plus de 20.000 échantillons qui sont conservés dans cette structure et une récente évaluation menée sur le plan national par la tutelle, a confirmé l'importance, du travail de l'équipe nantaise dans ce domaine.
Les laboratoires de génomique et de protéomique
Le laboratoire de biologie moléculaire du Centre a pour thématique principale la génomique du cancer du sein. Les techniques de typage des tumeurs par analyse du transcriptome (ensemble des ARN d'une cellule ou d'un tissu) et du protéome (ensemble des protéines d'une cellule ou d'un tissu) sont pratiquées depuis plus de dix ans, dans notre établissement.
L'étude du transcriptome est aujourd'hui possible grâce à l'apparition des techniques d'hybridation moléculaire (macroarrays, microarrays et puces à ADN). Les données brutes obtenues sont exploitées par des biostatisticiens dans le cadre d'études multicentriques.
L'étude du protéome fait également appel à des techniques de biologie moléculaire. Les données brutes sont traitées de la même manière que pour le transcriptome. L'identification des protéines d'intérêt nécessite un équipement de pointe (spectromètre de masse) dont le Centre est équipé depuis 2003.
L'activité du Centre est essentiellement tournée vers la pharmacogénomique fonctionnelle. qui consiste à définir les mécanismes moléculaires des traitements basés sur la chimiothérapie et d'adapter de manière quasi individuelle, un traitement à un patient donné, en fonction de son patrimoine génétique.
