Unité de Protéomique
L'objectif de cette unité est de rechercher des marqueurs protéiques moléculaires diagnostiques, pronostiques et prédictifs de la réponse aux traitements, afin de les utiliser pour une meilleure prise en charge des patients atteints de cancer ; ceci dans le but de proposer à chaque patient un « traitement à la carte », fonction des particularités propres de sa maladie. Ainsi, une fois cette démarche rendue possible, les patients recevront des soins personnalisés.
On appelle « protéome » l'ensemble des protéines de cellules ou tissus présent à un instant donné. Ce compartiment biologique succède et résulte d'un point de vue physiologique au « transcriptome », qui, lui, est l'ensemble des ARN de cellules ou tissus à un instant donné (d'une façon schématique, un ARN est transformé selon un code en une protéine). La protéomique est donc l'étude de l'ensemble ou d'un ensemble de protéines. Elle contribue avec la transcriptomique (voir UMGC) à la science à « grande échelle », grâce à la puissance des outils utilisés et au gain de temps qu'ils permettent. L'unité de protéomique focalise ses travaux sur le cancer du sein. Dans le cadre de collaborations, d'autres pathologies tumorales solides seront également étudiées avec ces outils (prostate, mésothéliome...).
Nous explorons le protéome en utilisant deux grands principes de séparation des protéines : l'électrophorèse bi-dimensionnelle (séparation des protéines dans un gel en fonction de leur masse et de leur charge dans d'un champ électrique) et la spectrométrie de masse (séparation des protéines par vol dans le vide en fonction de leur masse dans un champ électrique).
Actuellement, une équipe de 5 personnes intervient dans le fonctionnement de l'unité : deux biologistes, deux techniciens de laboratoire et une aide de laboratoire, en étroite collaboration avec une unité de biologie intégrée comprenant : un médecin statisticien, une biomathématicienne et un bioinformaticien.
L'unité de protéomique est impliquée dans différents projets de recherche promus par des biologistes, des cliniciens et/ou des chercheurs locaux (CLCC, Faculté des Sciences, INSERM...), régionaux (Cancéropôle Grand-Ouest...), nationaux (Programme Hospitalier de Recherche Clinique...)...